Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPL1Q96FJ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms