Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4CQ96CF2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4CQ96CF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms