Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COPS9Q8WXC6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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COPS9Q8WXC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS9Q8WXC6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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