Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BRK1Q8WUW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BRK1Q8WUW1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms