Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CARMIL3Q8ND23 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL3Q8ND23 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms