Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPC24Q8NBT2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPC24Q8NBT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms