Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPAP2Q8IXW5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPAP2Q8IXW5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms