Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LMNTD2Q8IXW0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms