Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDKL3Q8IVW4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms