Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKAP1Q86WV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms