Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLASP1Q7Z460 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLASP1Q7Z460 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms