Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC6Q7Z403 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms