Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00299Q6ZSB3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms