Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXO38Q6PIJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms