Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFXN4Q6P4A7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms