Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms