Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC70Q6NSX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC70Q6NSX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms