Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIRMAQ69YN4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VIRMAQ69YN4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms