Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC183Q5T5S1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC183Q5T5S1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms