Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf220Q5T0J3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms