Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FFAR4Q5NUL3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FFAR4Q5NUL3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms