Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms