Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms