Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP24-1Q3LI83 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP24-1Q3LI83 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms