Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC96Q2M329 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC96Q2M329 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms