Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAPTM4AQ15012 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LAPTM4AQ15012 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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