Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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CKAP5Q14008 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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