Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLF9Q13886 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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