Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRR1Q13601 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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