Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMAD4Q13485 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD4Q13485 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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