Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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