Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SF3B2Q13435 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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