Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBX3Q13185 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX3Q13185 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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