Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFT88Q13099 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms