Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL16A1Q07092 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL16A1Q07092 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms