Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPCQ01831 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPCQ01831 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPCQ01831 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
XPCQ01831 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
XPCQ01831 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
XPCQ01831 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
XPCQ01831 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms