Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms