Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRB1P82279 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRB1P82279 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRB1P82279 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRB1P82279 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CRB1P82279 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CRB1P82279 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CRB1P82279 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CRB1P82279 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
CRB1P82279 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRB1P82279 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms