Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IRX6P78412 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX6P78412 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX6P78412 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX6P78412 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms