Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB1P62873 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB1P62873 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB1P62873 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB1P62873 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB1P62873 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms