Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RPS29P62273 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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