Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERV-K104P61576 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms