Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms