Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX9P55771 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX9P55771 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms