Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD23BP54727 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD23BP54727 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms