Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOSBP53539 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOSBP53539 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOSBP53539 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOSBP53539 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOSBP53539 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms