Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTCFP49711 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTCFP49711 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTCFP49711 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CTCFP49711 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTCFP49711 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms