Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP4P49662 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP4P49662 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP4P49662 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms