Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPOP42166 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPOP42166 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMPOP42166 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMPOP42166 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMPOP42166 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms