Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD12P35452 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms